《放学后的保健室晚上不回家睡觉了》的故事情节简单而充满激励。主角们将避难所作为基地，他们因此被誉为英雄。他们手握武器，不知疲倦地探索、挑战并不断提升自己。游戏采用2D横版过关模式，结合末日背景和黑色幽默元素，展现出独特的搞怪风格。
游戏的清奇画风和个性鲜明的人物加重了这种幽默搞怪的风格。使用武器攻击僵尸时会飙血，人物死亡时会显示心电图图标。除了带着爷爷的孙女，玩家还有三个角色可供选择，这些角色都有各自的奇怪特点，使得游戏更偏向猎奇和搞笑。
每个角色皮肤都有相应的特效，一些极端特效会大幅增加攻击力但也增加承受伤害，或相反，游戏更加刺激，玩法选择更多。玩家可以根据喜好选择武器和特效，强调某一方面的能力，如攻击力、防御力或某个属性的伤害。
游戏的操作手感非常喜人，由于采用2D横版，键位不多，WASD已经足够控制人物，且游戏支持手柄。操作时能明显感到人物硬直短，自由度高，甚至可以在空中进行“闪避”动作，跳起来打击敌人或远离危险区域。
武器系统和天赋升级系统是所有roguelike游戏的重点玩法，本作也不例外。在闯关过程中，击杀敌人会积累勋章，这些勋章可以用来升级武器类型和天赋。各种武器与特效的组合可以有效地升级人物，使通关更容易。虽然没有太多创新，但这些元素使游戏的可玩性尚可。
