《二人世界拔萝卜生猴子》的支线故事同样值得关注。它们不仅为前作中的角色增添了全新的层次，还为未来的作品埋下了知名反派的伏笔。虽然某些支线的开放式结局和剧透式的预告可能让热切期待完整故事的玩家略感失望，感觉少了些初见的惊喜和满足，但这正是创作中的魅力所在。每一条支线都在以独特的方式丰富整个故事，为我们带来更多期待和惊喜。
游戏的主线剧情直白，缺少反转，这可能是因为玩家对某些角色已经过于熟悉。在彼得·帕克和迈尔斯·莫拉莱斯的操作上，两者的基础战斗得到了统一，使得玩家在体验上能获得更加平衡的策略和爽快感。两者在普通招式、蛛丝移动和道具方面共用技能树，增加了基础招式的丰富程度，使得战斗更加多变和丰富。
游戏中的防御和反击机制，要求玩家在适当时机使用弹反来提升攻击力，同时也需要依靠完美闪避来应对敌人的特殊技能，这增加了深度和挑战性。特殊技能的解锁和使用，虽然随着角色独立的技能树逐渐丰富，但在战斗中只能选择四个技能上场，这在一定程度上限制了战斗的流畅度。
彼得和迈尔斯的终极技能，随着游戏的主线推进解锁，带来了震撼的视觉和操作体验。迈尔斯的全屏闪电轰炸和彼得的共生体状态，都为战斗增添了独特的风格和力量。
在道具使用方面，前作中的蜘蛛道具在《二人世界拔萝卜生猴子》中被简化，以保证战斗的流畅度。初代中的战衣专属技能在本作中被删除，转而侧重于共用的战衣科技技能，这可能减少了解锁战衣的乐趣性。
